O Ministério do Interior vem investigando, desde 1981, a atuação das missões católicas e evangélicas na calha norte dos rios Solimões e Amazonas, recolhendo subsídios para os estudos do Conselho de Segurança Nacional (CSN) em função do "Projeto Calha Norte" (ocupação militar na fronteira norte brasileira). Na área dos 9 mil índios Yanomanis, na fronteira do Brasil com a Venezuela, atuam, com 50 missionários norte-americanos, duas missões: A Meva (Missões Evangélicas da Amazônia) e a NTB (Novas Tribos do Brasil). Atuam também duas missões católicas: a Salesiana de Dom Bosco e a Consolata, ligadas ao CIMI (Conselho Indigenista Missionário), órgão da CNBB. E entre os índios Sataré/Maué e Pecanova, atua, há 16 anos, a seita SIL (Summer Institute of Linguiatics, dos EUA), que se dedica a pesquisar as línguas indígenas (FSP).